Le commissionnaire agréé se présente avec le bulletin de paiement au service du trésor. L'agent du trésor contrôle que la somme remise pour le paiement (chèque, espèces, bordereau de versement) est bien conforme au montant figurant sur le bulletin.

L'agent renseigne ensuite le système informatique avec le nom du déclarant, le numéro d'identification fiscale, le bureau concerné et le numéro de la liquidation. Il remet une quittance de paiement au commissionnaire agréé.

NB: Lorsqu'il s'agit de produits ne bénéficiant pas d'exonération, les différents taux pour le calcul des droits à payer sont : droits de douanes (20%), redevance statistique (1%), prélèvement communautaire de solidarité (1%), et prélèvement communautaire (0.5%).